MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA518

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017495	TCAAT	2	10	179	188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017495	A	7	7	228	234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017495	A	7	7	236	242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017495	TAT	2	6	252	257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017495	AT	3	6	256	261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017495	TA	3	6	268	273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017495	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017495	GAG	2	6	319	324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017495	ATA	2	6	441	446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017495	A	6	6	458	463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017495	TTC	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017495	T	8	8	2466	2473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017495	TA	4	8	5003	5010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017495	CACC	2	8	5078	5085	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_017495	GTG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017495	ATT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017495	G	6	6	5116	5121	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017495	CACT	2	8	5122	5129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017495	ACC	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017495	A	6	6	5666	5671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017495	GA	3	6	5672	5677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017495	T	6	6	5713	5718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017495	TCT	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017495	GTT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017495	GAA	2	6	5744	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017495	TTTTA	2	10	5752	5761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017495	T	8	8	5764	5771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017495	TAAAA	2	10	5779	5788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017495	GAAA	2	8	5849	5856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017495	ATTTTT	2	12	5860	5871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017495	CGA	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017495	A	7	7	5985	5991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017495	ATT	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017495	CAA	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017495	ATA	2	6	6093	6098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017495	TGA	2	6	6156	6161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017495	CAG	2	6	6245	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017495	TTA	2	6	6251	6256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017495	ATC	2	6	6261	6266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017495	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017495	A	6	6	6331	6336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017495	TGT	2	6	6351	6356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017495	GTT	2	6	6383	6388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017495	TA	3	6	6405	6410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017495	TAA	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017495	CTTTT	2	10	7061	7070	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017495	T	6	6	7067	7072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017495	ATT	2	6	7080	7085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017495	ATA	2	6	7088	7093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017495	CAA	2	6	7151	7156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017495	GTC	2	6	7204	7209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017495	TTA	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017495	AT	3	6	7324	7329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017495	TTG	2	6	7337	7342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017495	AAG	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017495	TCC	2	6	7427	7432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017495	TAC	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017495	TA	3	6	7466	7471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017495	TAA	2	6	7523	7528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017495	TAA	2	6	7532	7537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017495	AAG	2	6	7541	7546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017495	T	6	6	7584	7589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017495	ATA	2	6	7635	7640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017495	TTCT	2	8	7731	7738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017495	ACA	2	6	7750	7755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017495	CTT	3	9	7786	7794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017495	TAAT	2	8	7802	7809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017495	TA	4	8	7869	7876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017495	TCA	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017495	TG	3	6	7892	7897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017495	T	6	6	7907	7912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017495	TAAT	2	8	7916	7923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017495	GTG	2	6	7957	7962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017495	TGA	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017495	TATG	2	8	8064	8071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017495	ACA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017495	TTAT	2	8	9577	9584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017495	ATG	2	6	9626	9631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017495	TATAA	2	10	9674	9683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017495	T	8	8	10604	10611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017495	TTA	2	6	10621	10626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017495	GA	3	6	10655	10660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017495	GAA	2	6	10670	10675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017495	ATT	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017495	AAG	2	6	10770	10775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017495	AT	3	6	10840	10845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017495	AAG	2	6	11533	11538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017495	TAT	2	6	16567	16572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017495	A	7	7	16588	16594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017495	ATT	2	6	16644	16649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017495	TTGC	2	8	16829	16836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017495	ATTT	2	8	16930	16937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017495	TAT	2	6	17020	17025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017495	TTTA	2	8	17100	17107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017495	GCT	2	6	17128	17133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017495	TTTC	2	8	17145	17152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017495	ATC	2	6	17175	17180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017495	TCT	2	6	17272	17277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017495	GAT	2	6	17284	17289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017495	ATA	2	6	17404	17409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017495	AGCTAC	2	12	17410	17421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017495	ATC	2	6	17423	17428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017495	A	6	6	17463	17468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017495	ATAA	2	8	17556	17563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017495	TACA	2	8	17604	17611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017495	ATT	2	6	17647	17652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.